Minden tematikus ülést három felvezető előadás indít, amelyeket egy fejlődő ország, egy fejlett ország és egy nemzetközi szervezet, illetve egy nem kormányzati szervezet (NGO) képviselői tartanak. A felvezetőket moderált davosi stílusú panelbeszélgetések követik, figyelembe véve a résztvevők kiegyensúlyozott földrajzi megoszlását. Az egyes ülések megállapításait jelentéstevők foglalják össze, akik a záró plenáris ülésen ismertetik a vonatkozó eredményeket. A rendezvény utolsó napján, a záró plenáris ülés előtt kerül elfogadásra a Budapesti Nyilatkozat 2016, amelybe a tematikus ülések eredményei is beépítésre kerülnek.
A Budapesti Víz Világtalálkozó 2016 üléseivel párhuzamosan a meghatározó érdekcsoportok találkozói zajlanak a következők szerint:
- Tudomány és Technológia Fórum
- Ifjúsági Fórum
- Civil Fórum
- Női Fórum
A fórumok is felkérést kapnak, hogy hozzájáruljanak a Budapesti Nyilatkozat 2016 tartalmához.
A Budapesti Víz Világtalálkozó 2016 megnyitó ünnepségére november 28-án 10 órakor kerül sor a Millenáris Park Színháztermében. A tervek szerint a Víz Világtalálkozó 2016. november 30-án 17 órakor zárul.
A Víz Világtalálkozó 2016 margóján "Fenntartható Vízipari Megoldások" címmel szakkiállításra is sor kerül. A szakkiállítás a fenntartható, környezetbarát, innovatív, versenyképes vízipari megoldások bemutatásán keresztül kínál lehetőséget azon vízipari vállalkozások számára, amelyek aktívan kapcsolódnak a víz kérdésköréhez.